Pavle, právě tím převařením ;-).
Kořeny nevařím, podle mě je to může naopak poničit. Opláchnu pod vlažnou vodou, případně odrbu kartáčem, a šup do akva. Nějak nevěřím představám, že na kořenu sedí nějaký rybí bacil a natěšeně cinká o sebe příborem, když ten kořen konečně někdo sebere a chystá se ho hodit do akvária :-D Plísně atd. - to jednak ke dřevu patří a nevidím v tom problém, a pak si taky myslím, že to postihne pravděpodobněji to dřevo, které je porušené varem.
Listy většinou před použitím vařím právě za tím účelem, aby šly hned ke dnu (používám je jako krmení pro šneky). Nevařené klesnou samy, ale trvá to několik dní. Jinak dub je super, ale chce to sbírat už uschlé a úplně hnědé listí, ať se to potom ve vodě nerozkládá.
(Jo a letos jsem si před prázdninama nachystala loňské listí do zavařeninové sklenice, napustila vodou a jednou za týden odtud něco vyberu a dám do akvária. Takhle nemusím nic vařit, listy namočené 2-3 měsíce už jdou ke dnu hned. Jsou slizké, ale neoplachuju je, to je pro šneky mňamka.)